Sortering af RNA i cellekernen

Pattedyrsgenomer er hyperaktive, men paradoksalt nok bliver en stor del af det producerede RNA hurtigt nedbrudt i cellekernen. Da labilt RNA deler fælles træk med dets stabile modpart, motiverer det spørgsmålet: Hvilke molekylære mekanismer i kernen sorterer RNA mellem stabile, funktionelle RNA-proteinpartikler og RNA der nedbrydes? Vi har tidligere fundet, at det essentielle ARS2-protein har binære funktioner i RNA-modning og -nedbrydning. Givet proteinets tilstedeværelse på nydannet RNA, foreslår vi, at RNAs skæbne bestemmes ved produktive og destruktive faktorers konkurrerende interaktion med ARS2. Ved kortlægning af de ansvarlige proteinkomplekser og domæner, vil vi afdække den underliggende molekylære logik, både under steady state samt i den dynamiske kontekst af stamcelledifferentiering. Vores arbejde vil afdække det fundamentale spørgsmål om, hvordan celler håndterer en massiv genomisk produktion uden fejlagtigt at nedbryde funktionelt RNA.