Peptide barcode enabled lineage tracing with mass spectrometry based single-cell proteomics

Vores forståelse af, hvordan cellulære programmer styrer det komplekse molekylære maskineri til at skabe multicellulære organismer og de indviklede fælles interaktioner mellem bakterier og svampe, er et af de grundlæggende spørgsmål i biologi. Fremkomsten af teknologier til at spore nedarvning har givet en utrolig indsigt i dette afgørende område. I dag er sådanne sporingsteknologier baseret på nukleotidsekventeringsteknologi, der måler transkripter, men som er blind for proteiner - cellens funktionelle underenheder. Vi vil derfor udvikle et værktøj, der kombinerer sporing af celleafkom enkeltcelle-proteomik baseret på massespektrometri (MS). Med genteknologi vil vi etablere korte unikke peptidsekvenspaneler, der kan blandes og matches for at generere tusindvis af unikke stregkoder til at mærke individuelle celler. Disse stregkoder forbliver stabile ved celledeling og kan måles med MS, hvorved der opnås både afstamningsoplysninger og det cellulære proteom.