Integration of protein dynamics in Deep Generative models for accelerating protein design (Deep design)

Integration af proteindynamik i maskinlæringsmodeller for accelereret protein design

Proteiner er nanoskala maskiner, der skaber basis for liv ved at drive størstedelen af biologiske og bioteknologiske processer. Disse maskiner er evolutionært optimerede til både effektivitet og specificitet. Hvis vi i et laboratorie kunne imitere naturens evne til at skabe skræddersyede proteiner ville det være transformerende for vores hverdag, for eksempel igennem øget bæredygtige produktionslinjer og biomedicin.

DEEP-Tailor er et synergistisk samarbejde mellem biofysik og kunstig intelligens med en todelt overordnet målsætning: Opbygge en detaljeret forståelse af proteindynamikkens rolle for funktion gennem biofysiske- og enkeltmolekyle eksperimenter og at integrere denne viden i dybe generative modeller og Bayesianske optimeringsprocedurer til at inkorporere forskelligartede eksperimenter og bringe dem i harmonisk samspil.

Vi forventer, at vores resultater vil danne grundlag for fremtidige proteintekniske løsninger i biomedicin, grøn kemi, samt bidrage til Danish Green chemistry initiative.